RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 CFLARO15519 480 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 C2P06681 752 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 POLBP06746 335 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 ITGAXP20702 1163 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 COPAP53621 1224 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 PKNOX1P55347 436 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 ASPHQ12797 758 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 NOTUMQ6P988 496 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 ALKAL1Q6UXT8 129 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 NUF2Q9BZD4 464 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 MORF4L1Q9UBU8 362 aa18.52■□□□□ 0.56
PANX1-201ENST00000227638 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 BIRC5O15392 142 aa18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 AQP4P55087 323 aa18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 CTBP1Q13363 440 aa18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 CFAP157Q5JU67 520 aa18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 SHCBP1Q8NEM2 672 aa18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 ETAA1Q9NY74 926 aa18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa18.52■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 TXNDC9O14530 226 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 IL1BP01584 269 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 RAB27AP51159 221 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 TTC3P53804 2025 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 CRYBG2Q8N1P7 616 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 PLXNB2O15031 1838 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 G3V2L1 256 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 SETSIPP0DME0 302 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 GP5P40197 560 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 PGFP49763 221 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 TAF6P49848 677 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 POU5F1BQ06416 359 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 DLG1Q12959 904 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 GRM3Q14832 879 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 POU6F1Q14863 301 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 EFHC1Q5JVL4 640 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 TIFABQ6ZNK6 161 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 C3orf58Q8NDZ4 430 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 NPY6RQ99463 290 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 ECSITQ9BQ95 431 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 ZNF212Q9UDV6 495 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 CDH22Q9UJ99 828 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 IPPQ9Y573 584 aa18.51■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 A0A1B0GVG6 124 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 NEMP2A6NFY4 417 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 STAU1O95793 577 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 MT-CO1P00395 513 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 NPR3P17342 541 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 AOC1P19801 751 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 UBXN11Q5T124 520 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 IRGCQ6NXR0 463 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 ARCQ7LC44 396 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 ARHGAP24Q8N264 748 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 KCTD4Q8WVF5 259 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 GATA6Q92908 595 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 PTPN18Q99952 460 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 DUSP16Q9BY84 665 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 SCOCQ9UIL1 159 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 F8W810 466 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 PTGESO14684 152 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 AURKAO14965 403 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 DCLK1O15075 740 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 OPHN1O60890 802 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 LYNP07948 512 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 CTSHP09668 335 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 HDCP19113 662 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 ADRA1BP35368 520 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 FDFT1P37268 417 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 TPI1P60174 286 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 MPP1Q00013 466 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 DPYSQ14117 519 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 SNX17Q15036 470 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 DGKDQ16760 1214 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.5■□□□□ 0.55
PANX1-201ENST00000227638 NXNQ6DKJ4 435 aa18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms