RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PdgfraP26618 1089 aa31.19■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MkksQ9JI70 570 aa31.19■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm13275B1AYI8 182 aa31.18■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm13278Q8CD73 182 aa31.18■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 BC024978J3QPC3 361 aa31.16■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fgf10O35565 209 aa31.16■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gsto2Q8K2Q2 248 aa31.15■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vps28Q9D1C8 221 aa31.15■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Il1rl2Q9ERS7 574 aa31.15■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm28919A0A087WP35 240 aa31.14■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm6121L7MUF1 212 aa31.14■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Msx3P70354 204 aa31.14■■■□□ 2.58
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rnf112Q96DY5 654 aa31.13■■■□□ 2.57
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Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TyrobpO54885 114 aa31.13■■■□□ 2.57
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