RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000084589.10

Cln3-202, Transcript of Battenin, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cln3, Length 3,203 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tmem45aQ60774 273 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Akap7Q7TN79 314 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Cep104Q80V31 926 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Prr11Q8BHE0 368 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 CenpuQ8C4M7 410 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fcho1Q8K285 873 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Acvr1cQ8K348 493 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Pcdhb13Q91Y06 796 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Krt5Q922U2 580 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Reep3Q99KK1 254 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Trap1Q9CQN1 706 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fgf22Q9ESS2 162 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Chrac1Q9JKP8 129 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 IkbkeQ9R0T8 717 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 DgkeQ9R1C6 564 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Cib2Q9Z309 187 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fam81bA0A140LI28 432 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Arhgef26D3YYY8 869 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Xbp1O35426 267 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Pou5f1P20263 352 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Itgb7P26011 806 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 CtswP56203 371 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Rps24P62849 133 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 ArvcfP98203 962 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Faf2Q3TDN2 445 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ceacam5Q3UKK2 947 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tmem65Q4VAE3 234 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Phactr4Q501J7 694 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gpr17Q6NS65 339 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fam205cQ80YD3 371 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 MylipQ8BM54 445 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Slco2b1Q8BXB6 683 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 DrgxQ8BYH0 263 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Itpk1Q8BYN3 419 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Rev1Q920Q2 1249 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Rin1Q921Q7 763 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Bzw1Q9CQC6 419 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Oma1Q9D8H7 521 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Dusp6Q9DBB1 381 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Oaz3Q9R109 243 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Arid3bQ9Z1N7 568 aa9.6□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gm9774A0A0A6YVU8 407 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Rabgap1lA6H6A9 815 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Dpysl2O08553 572 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 NmbrO54799 390 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 PcnaP17918 261 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mc1rQ01727 315 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 GaltQ03249 379 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fam171bQ14CH0 825 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Fam35aQ3UEN2 891 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Cd6Q61003 665 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Krt32Q62168 407 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 RbfaQ6P3B9 350 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tas2r109Q7M707 316 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tas2r129Q7M709 320 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 ItpkcQ7TS72 678 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Got1l1Q7TSV6 404 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 AarsQ8BGQ7 968 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Epb41l5Q8BGS1 731 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gbp5Q8CFB4 590 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 TwnkQ8CIW5 685 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ipo11Q8K2V6 975 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 KlbQ99N32 1043 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Ska2Q9CR46 120 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Q9D979 236 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 PalmdQ9JHU2 551 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Olfr1049A2ARZ0 308 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Rap1gds1E9Q912 607 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Prkag1O54950 330 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Il12bP43432 335 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Slc24a2Q14BI1 711 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 March5Q3KNM2 278 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Casc4Q6P2L7 435 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Hmgb4Q6P8W9 181 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Prdm4Q80V63 803 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 BoraQ8BS90 525 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Clip4Q8CI96 704 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Slf1Q8R3P9 1054 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 AuhQ9JLZ3 314 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 PigqQ9QYT7 581 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Galk1Q9R0N0 392 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Gm11983V9GXS8 105 aa9.59□□□□□ -0.87
Cln3-202ENSMUST00000084589 Klf6O08584 283 aa9.58□□□□□ -0.88
Cln3-202ENSMUST00000084589 Cacna1cQ01815 2139 aa9.58□□□□□ -0.88
Cln3-202ENSMUST00000084589 Cpne7Q0VE82 557 aa9.58□□□□□ -0.88
Cln3-202ENSMUST00000084589 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tmem255bQ5FW56 369 aa9.58□□□□□ -0.88
Cln3-202ENSMUST00000084589 Mfsd3Q5U419 412 aa9.58□□□□□ -0.88
Cln3-202ENSMUST00000084589 Zdhhc18Q5Y5T2 380 aa9.58□□□□□ -0.88
Cln3-202ENSMUST00000084589 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tpp2Q64514 1262 aa9.58□□□□□ -0.88
Cln3-202ENSMUST00000084589 Tatdn1Q6P8M1 295 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.3 ms