RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f19A2CG71 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f10A2CG92 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f3A2CGC2 496 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f13B8JKF6 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cldn24D3YXJ9 220 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10719E9Q7T3 227 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f2J3QMS5 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f25J3QMV9 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f6J3QMW9 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f26J3QNK2 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f24J3QNQ5 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f8J3QQ50 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f17L7MU81 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f18L7MU83 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 L1camP11627 1260 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aldh3a1P47739 453 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plk2P53351 682 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sox8Q04886 464 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd36Q08857 472 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f14Q1LZI5 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmed1Q3V009 227 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f27Q5FWA1 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cypt2Q6P924 180 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr139Q80UC8 345 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc18a2Q8BRU6 517 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slco6c1Q8C0X7 706 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LnpepQ8C129 1025 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx8Q8CFD4 459 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kct2Q8K201 259 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam32Q8K410 754 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr393Q8VGR6 312 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdha6Q91Y14 946 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rtfdc1Q99K95 307 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Me2Q99KE1 589 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtfr1Q99MB2 328 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GMCL1P1Q99N64 498 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dis3Q9CSH3 958 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hacd2Q9D3B1 254 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmd13Q9WVJ2 376 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RecqlQ9Z129 648 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Chek2Q9Z265 546 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SisF8VQM5 1818 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 C87414E9PWI7 475 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxl18E9PYR1 771 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zscan4bE9Q3G0 505 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr292F8VQ84 308 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r19G5E8G4 854 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7942L7N277 499 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Matn2O08746 956 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acot1O55137 419 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HcrtO55241 130 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fgl2P12804 432 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scd1P13516 355 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MutP16332 748 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PpargP37238 505 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tubgcp3P58854 905 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sycp3P70281 254 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vps45P97390 570 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp9bP98195 1146 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hexim2Q3TVI4 313 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scn2bQ56A07 215 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndrg1Q62433 394 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HltfQ6PCN7 1003 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sel1l3Q80TS8 1137 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Armc12Q80X86 340 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp398Q8BV16 643 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 TbcdQ8BYA0 1196 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb10Q8K1K6 397 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspan14Q8QZY6 270 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rem2Q8VEL9 341 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tubgcp4Q9D4F8 667 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc97Q9DBT3 340 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rmdn1Q9DCV4 305 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cpxm1Q9Z100 722 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gria4Q9Z2W8 902 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 UtrnE9Q6R7 3430 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grin3aA2AIR5 1135 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc4a11A2AJN7 862 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp4f17G3UW78 524 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ifi206G3UZV2 921 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp850J3QPC5 689 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CenpaO35216 134 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NoctO35710 429 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ptpn1P35821 432 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DmpkP54265 631 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fitm2P59266 262 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PgrQ00175 926 aa6.73□□□□□ -1.33
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trafd1Q3UDK1 580 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.8 ms