RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	TRPC3	Q13507	836 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	PGM5	Q15124	567 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	LIPM	Q5VYY2	423 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	ATG16L1	Q676U5	607 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	DEF8	Q6ZN54	512 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	FAM47B	Q8NA70	645 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	HTRA1	Q92743	480 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	KCNJ9	Q92806	393 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	PPM1M	Q96MI6	270 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175		Q9N2J8	555 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	GDA	Q9Y2T3	454 aa		3.41	□□□□□ -1.86
ATRX-223	ENST00000637175	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175		E5RJQ4	531 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TP73	O15350	636 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CELA2A	P08217	269 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CYP4B1	P13584	511 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	EPHB2	P29323	1055 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	MPG	P29372	298 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TYK2	P29597	1187 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	GJC1	P36383	396 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	OAZ1	P54368	228 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	DLGAP5	Q15398	846 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	GJB7	Q6PEY0	223 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	RNF144B	Q7Z419	303 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	NEK8	Q86SG6	692 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	VPS52	Q8N1B4	723 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ESX1	Q8N693	406 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	NAXE	Q8NCW5	288 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	KAT2B	Q92831	832 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	RNFT2	Q96EX2	444 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ARL15	Q9NXU5	204 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		3.4	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PEX12	O00623	359 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CD63	P08962	238 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CTSA	P10619	480 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	CPA1	P15085	419 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	STAT1	P42224	750 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	LIFR	P42702	1097 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	MTNR1A	P48039	350 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TUB	P50607	506 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	ARHGAP8	P85298	464 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	PLK5	Q496M5	336 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	AADACL2	Q6P093	401 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	FAM57B	Q71RH2	274 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	KLB	Q86Z14	1044 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	NCSTN	Q92542	709 aa		3.39	□□□□□ -1.87
ATRX-223	ENST00000637175	IP6K1	Q92551	441 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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