RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 KATNA1O75449 491 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MLNP12872 115 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CLCN5P51795 746 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 USP41Q3LFD5 358 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GALNTL6Q49A17 601 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 VPS33AQ96AX1 596 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R16AQ96I34 528 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 APOL2Q9BQE5 337 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.59□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SNED1Q8TER0 1413 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 BIRC5O15392 142 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ALBP02768 609 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINA4P29622 427 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 POLD2P49005 469 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NCALDP61601 193 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KYQ8NBH2 561 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 VPS50Q96JG6 964 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM161AQ9NX61 479 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SPASTQ9UBP0 616 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 USP20Q9Y2K6 914 aa6.59□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KPNA5O15131 536 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KRT34O76011 436 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MTA2O94776 668 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ALDH1A2O94788 518 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SSTR1P30872 391 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FAAP100Q0VG06 881 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CYTH1Q15438 398 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ARCQ7LC44 396 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RPTORQ8N122 1335 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 USP1O94782 785 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DGKAP23743 735 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PPM1AP35813 382 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 DMC1Q14565 340 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RCN1Q15293 331 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEC3Q8TD91 643 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 INPP5DQ92835 1189 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 UBP1Q9NZI7 540 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RCCD1A6NED2 376 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 SNTNA6NMZ2 147 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MAP3K13O43283 966 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CILPO75339 1184 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ASGR1P07306 291 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PSMB4P28070 264 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CPA2P48052 419 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PRIM2P49643 509 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CHRNB3Q05901 458 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 RNF43Q68DV7 783 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MON1BQ7L1V2 547 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PIGZQ86VD9 579 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 PRELID2Q8N945 189 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.58□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
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