RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa12.15□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 CLSTN1O94985 981 aa12.15□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 TBX18O95935 607 aa12.15□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 TRAPPC10P48553 1259 aa12.15□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 SLC5A3P53794 718 aa12.15□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 ADPRHP54922 357 aa12.15□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 MLLT10P55197 1068 aa12.15□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 MDH1BQ5I0G3 518 aa12.15□□□□□ -0.46
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HCG18-241ENST00000602290 LRRC31Q6UY01 552 aa12.15□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 KCNK18Q7Z418 384 aa12.15□□□□□ -0.46
HCG18-241ENST00000602290 CCDC83Q8IWF9 413 aa12.15□□□□□ -0.46
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HCG18-241ENST00000602290 MSANTD4Q8NCY6 345 aa12.15□□□□□ -0.46
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HCG18-241ENST00000602290 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 K7ESM1 405 aa12.14□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 CHUKO15111 745 aa12.14□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 UGT1A5P35504 534 aa12.14□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 MNAT1P51948 309 aa12.14□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 HSP90B2PQ58FF3 399 aa12.14□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 DPH6Q7L8W6 267 aa12.14□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 RDH13Q8NBN7 331 aa12.14□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 TPCN2Q8NHX9 752 aa12.14□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 MAGEC3Q8TD91 643 aa12.14□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa12.14□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 SEPT10Q9P0V9 454 aa12.14□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa12.14□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 KLRB1Q12918 225 aa12.13□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 RNF217Q8TC41 542 aa12.13□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 MYO19Q96H55 970 aa12.13□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 OSER1Q9NX31 292 aa12.13□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 MCM8Q9UJA3 840 aa12.13□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 STYXL1Q9Y6J8 313 aa12.13□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 PCSK5Q92824 1860 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 MYH11P35749 1972 aa12.12□□□□□ -0.47
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HCG18-241ENST00000602290 MID1O15344 667 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 STC2O76061 302 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 IL18RAPO95256 599 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 RARGP13631 454 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 HLA-FP30511 346 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 SLC6A4P31645 630 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA8FQ08AF8 430 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 CST6Q15828 149 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 E2F4Q16254 413 aa12.12□□□□□ -0.47
HCG18-241ENST00000602290 CDKN3Q16667 212 aa12.12□□□□□ -0.47
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