RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	C2orf54	Q08AI8	447 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	GRM2	Q14416	872 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	C14orf80	Q86SX3	495 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	DENND1C	Q8IV53	801 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	YAF2	Q8IY57	180 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	E2F7	Q96AV8	911 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	HAUS1	Q96CS2	278 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.12	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CLDN11	O75508	207 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	FCAR	P24071	287 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	NDST2	P52849	883 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CDH4	P55283	916 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TCF15	Q12870	199 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	PDK1	Q15118	436 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	LLGL1	Q15334	1064 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	AFMID	Q63HM1	303 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CHST9	Q7L1S5	443 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	OLFM3	Q96PB7	478 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	KRT12	Q99456	494 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	KLC2	Q9H0B6	622 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		13.11	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	MCF2L	O15068	1137 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	MTSS1	O43312	755 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	PI15	O43692	258 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ECEL1	O95672	775 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	GAS8	O95995	478 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	RBP3	P10745	1247 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	PSMC3	P17980	439 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	GDI1	P31150	447 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SLC6A4	P31645	630 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	VIPR2	P41587	438 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	PTGIR	P43119	386 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	DYNLT1	P63172	113 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	DR1	Q01658	176 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	PRKCQ	Q04759	706 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	USP4	Q13107	963 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	ZNF77	Q15935	545 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	C8orf74	Q6P047	294 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TTC27	Q6P3X3	843 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.1	□□□□□ -0.31
CELF4-222	ENST00000601392	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		13.1	□□□□□ -0.31

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