RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-215ENST00000592578 A0A1B0GTQ1 180 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 B8ZZF3 427 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SEMA4FO95754 770 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 APOEP02649 317 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 PRKCHP24723 683 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SLC6A4P31645 630 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CTSKP43235 329 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SGSHP51688 502 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 APBA1Q02410 837 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 TLE3Q04726 772 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 ZBTB16Q05516 673 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 TAC4Q86UU9 113 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CACUL1Q86Y37 369 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SLC39A13Q96H72 371 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 NOX5Q96PH1 765 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SGK2Q9HBY8 427 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.76□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 KCNK3O14649 394 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 FSBPO95073 299 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 DNTTP04053 509 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 GLI1P08151 1106 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 KRT9P35527 623 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 COPAP53621 1224 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SNX16P57768 344 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 IL9RQ01113 521 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 MBLAC2Q68D91 279 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 ADIPOR2Q86V24 386 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 MFN1Q8IWA4 741 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SIX2Q9NPC8 291 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 STIM2Q9P246 746 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CEP83Q9Y592 693 aa14.75□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 VILLO15195 856 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 BRINP1O60477 761 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 WISP1O95388 367 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 C6P13671 934 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 ACSL1P33121 698 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 BPIFB4P59827 614 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 DCAF6Q58WW2 860 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 FIBINQ8TAL6 211 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 BIRC7Q96CA5 298 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CPXM1Q96SM3 734 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 TMEM245Q9H330 911 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CKAP5Q14008 2032 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 MYLKQ15746 1914 aa14.74□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 HSF2BPO75031 334 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 IGLV3-25P01717 112 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 SLC2A3P11169 496 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 GLDCP23378 1020 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CD70P32970 193 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CDK17Q00537 523 aa14.73□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PSME3-215ENST00000592578 CDH18Q13634 790 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms