RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	HOXC8	P31273	242 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP2C18	P33260	490 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	HTR7	P34969	479 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TKTL1	P51854	596 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NRL	P54845	237 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DPYS	Q14117	519 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRPSAP1	Q14558	356 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	BNIPL	Q7Z465	357 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM35A	Q86V20	835 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	FAM228A	Q86W67	206 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	OSTM1	Q86WC4	334 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	METTL23	Q86XA0	190 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ACD	Q96AP0	544 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SKA1	Q96BD8	255 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NSL1	Q96IY1	281 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CPNE1	Q99829	537 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TLE6	Q9H808	572 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	EBF2	Q9HAK2	575 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MCM8	Q9UJA3	840 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	HAO1	Q9UJM8	370 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MID2	Q9UJV3	735 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DSE	Q9UL01	958 aa		9.44	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SCN1A	P35498	2009 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDR27	A2RRH5	827 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	GABRD	O14764	452 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TREH	O43280	583 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ADCY6	O43306	1168 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CREB3	O43889	395 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	RFPL1	O75677	317 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MAP3K6	O95382	1288 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	BPGM	P07738	259 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	VAV1	P15498	845 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	GP5	P40197	560 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SERPINB8	P50452	374 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	DAOA	P59103	153 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF33A	Q06730	810 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	WASHC5	Q12768	1159 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	NME3	Q13232	169 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	BMPR2	Q13873	1038 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CRYM	Q14894	314 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	E2F5	Q15329	346 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CHI3L2	Q15782	390 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	INSC	Q1MX18	579 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	WSCD1	Q658N2	575 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PACS1	Q6VY07	963 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	LONP2	Q86WA8	852 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF276	Q8N554	614 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	CCNY	Q8ND76	341 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	STKLD1	Q8NE28	680 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	AGAP11	Q8TF27	550 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	PGBD4	Q96DM1	585 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	P2RY11	Q96G91	374 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPC25	Q9HBM1	224 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	BFAR	Q9NZS9	450 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZFAT	Q9P243	1243 aa		9.43	□□□□□ -0.9
EFTUD2-222	ENST00000592408	HEY2	Q9UBP5	337 aa		9.43	□□□□□ -0.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms