RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RMI1Q9H9A7 625 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 LY9Q9HBG7 655 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 GIMAP2Q9UG22 337 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 USP22Q9UPT9 525 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RAD54BQ9Y620 910 aa4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MYH1P12882 1939 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 AFF2P51816 1311 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NRXN2Q9P2S2 1712 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SH3D21A4FU49 640 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SAC3D1A6NKF1 404 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 DRGXA6NNA5 263 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ADM5C9JUS6 153 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 AGPSO00116 658 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKAB2O43741 272 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MLYCDO95822 493 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 DNTTP04053 509 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FDPSP14324 419 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 HK1P19367 917 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RFC4P35249 363 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ME1P48163 572 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NT5C2P49902 561 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PRKAG1P54619 331 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RPS8P62241 208 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CAP1Q01518 475 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SATB1Q01826 763 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ROR1Q01973 937 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGFQ07326 219 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.699e-8■■■■■ 39.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MYBPC2Q14324 1141 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CSHL1Q14406 222 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 STX1AQ16623 288 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RNF151Q2KHN1 245 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 EFCAB12Q6NXP0 572 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MSANTD2Q6P1R3 559 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 LAYNQ6UX15 382 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 DOK3Q7L591 496 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TRABD2AQ86V40 505 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 SPARTQ8N0X7 666 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL36Q8N4N3 616 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MIGA1Q8NAN2 632 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 POC1BQ8TC44 478 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
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CAPNS1-210ENST00000590211 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PGBD1Q96JS3 809 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 WDR24Q96S15 920 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TCF25Q9BQ70 676 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 UBAC1Q9BSL1 405 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 FUZQ9BT04 418 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CXorf36Q9H7Y0 433 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CDYLQ9Y232 598 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 NR2E1Q9Y466 385 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PIAS3Q9Y6X2 628 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa4.5□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 LTBP1Q14766 1721 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 QSER1Q2KHR3 1735 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC78A2IDD5 438 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 BIN1O00499 593 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 DEXIO95424 95 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ADCY5O95622 1261 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 F9P00740 461 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 TPM3P06753 285 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CALM1P0DP23 149 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CALM2P0DP24 149 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 CALM3P0DP25 149 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 ACADMP11310 421 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNAR1P17181 557 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 GGT5P36269 586 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 MLH1P40692 756 aa4.49□□□□□ -1.69
CAPNS1-210ENST00000590211 LOXL3P58215 753 aa4.49□□□□□ -1.69
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