RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	RARRES1	P49788	294 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP2J2	P51589	502 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	BACE1	P56817	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CD69	Q07108	199 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CXCL9	Q07325	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64	1e-6	■■■■□ 24.4
PTPRM-215	ENST00000583289	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	PGM5	Q15124	567 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	DOK3	Q7L591	496 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	BBOF1	Q8ND07	529 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	NINJ1	Q92982	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	NT5C1B	Q96P26	610 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT12	Q99456	494 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	VWA5A	O00534	786 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	THAP12	O43422	761 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	TGM5	O43548	720 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAJC6	O75061	913 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	LY86	O95711	162 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	FTCD	O95954	541 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CXCR5	P32302	372 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	LSP1	P33241	339 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	MXI1	P50539	228 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	GPC3	P51654	580 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	EFNA5	P52803	228 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	PTEN	P60484	403 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	SNAP25	P60880	206 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CDR2	Q01850	454 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	GCNT1	Q02742	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CAV1	Q03135	178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	DUSP2	Q05923	314 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	PPAT	Q06203	517 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	FSTL1	Q12841	308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	STRN3	Q13033	797 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	MAPK7	Q13164	816 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	PLS1	Q14651	629 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PTPRM-215	ENST00000583289	METTL13	Q8N6R0	699 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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