RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NPY2R	P49146	381 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA3B	Q13214	749 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CES3	Q6UWW8	571 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	KRT82	Q9NSB4	513 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PNPO	Q9NVS9	261 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		18.83	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	BEST1	O76090	585 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	F9	P00740	461 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PRDX6	P30041	224 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2A2	P52657	109 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ITGA9	Q13797	1035 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NETO2	Q8NC67	525 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	AGAP3	Q96P47	875 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	GBA3	Q9H227	469 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	BTBD19	C9JJ37	291 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	APOA4	P06727	396 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	LINGO3	P0C6S8	592 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJB2	P25686	324 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINB6	P35237	376 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K7CL	P57077	242 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	IRF5	Q13568	498 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD10	Q14728	455 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CFAP157	Q5JU67	520 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	WSCD1	Q658N2	575 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	KCTD11	Q693B1	232 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	MAVS	Q7Z434	540 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	HDAC11	Q96DB2	347 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	IL22	Q9GZX6	179 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		18.82	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TSC2	P49815	1807 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF195	O14628	629 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CYP2B6	P20813	491 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	EPHX2	P34913	555 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	DAOA	P59103	153 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM17	P78536	824 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	DSG1	Q02413	1049 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	JADE3	Q92613	823 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		18.81	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559		A0A096LPK6	155 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	FAM72C	H0Y354	149 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	HSPA4L	O95757	839 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	FYN	P06241	537 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	LHX1	P48742	406 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A3	Q00325	362 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CCL15	Q16663	113 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC14A	Q86T13	490 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	FAM72B	Q86X60	149 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	EPAS1	Q99814	870 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	MEI4	A8MW99	385 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NRP1	O14786	923 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ADCY6	O43306	1168 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	GALNT2	Q10471	571 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	LCA5	Q86VQ0	697 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	URGCP	Q8TCY9	931 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	SYT15	Q9BQS2	421 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	CDH19	Q9H159	772 aa		18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	18.8	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD3	O43242	534 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM13	O60858	407 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	USP12	O75317	370 aa		18.79	■□□□□ 0.6
RRN3-205	ENST00000563559	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms