RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561407.1

TMOD2-206, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-206ENST00000561407 PI4K2BG5E9Z4 385 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 MYO1CO00159 1063 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 TNFSF14O43557 240 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 C1QL1O75973 258 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CER1O95813 267 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 VIPP01282 170 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 IGLV2-14P01704 120 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 IGHDP01880 384 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 PDHA1P08559 390 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 NR2F6P10588 404 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 PGM1P36871 562 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 VIPR2P41587 438 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 MMP14P50281 582 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 LILRA4P59901 499 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 PLIN5Q00G26 463 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 MAMLD1Q13495 774 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 DCTN1Q14203 1278 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 IQCB1Q15051 598 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ASIC2Q16515 512 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 MSANTD2Q6P1R3 559 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CEP97Q8IW35 865 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 WDTC1Q8N5D0 677 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ATP2A3Q93084 1043 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ELP4Q96EB1 424 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 BRD8Q9H0E9 1235 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 SYNCQ9H7C4 482 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 PDE7BQ9NP56 450 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ASB6Q9NWX5 421 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 NDUFAF4Q9P032 175 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 COX11Q9Y6N1 276 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa4.05□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CD109Q6YHK3 1445 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 POGZQ7Z3K3 1410 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 GPRASP1Q5JY77 1395 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 FLT1P17948 1338 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 LINC00473A8K010 186 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 M0QYT0 321 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 PIAS2O75928 621 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 TGDSO95455 350 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ERBB2P04626 1255 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 NTSR1P30989 418 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 HTR7P34969 479 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 NNMTP40261 264 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 SNX16P57768 344 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 LOXL3P58215 753 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 PPARDQ03181 441 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 EPS8Q12929 822 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 STK4Q13043 487 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 GPS1Q13098 491 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CHAF1BQ13112 559 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 RPS6KA2Q15349 733 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CCDC142Q17RM4 750 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 LAYNQ6UX15 382 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 IKBIPQ70UQ0 350 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 ADGRA1Q86SQ6 560 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CNTROBQ8N137 903 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 AVL9Q8NBF6 648 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 AFAP1L1Q8TED9 768 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CPT1BQ92523 772 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CUL5Q93034 780 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 FKBP10Q96AY3 582 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CALML4Q96GE6 196 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 PBKQ96KB5 322 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 WDR24Q96S15 920 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 TIMP4Q99727 224 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
TMOD2-206ENST00000561407 NDST4Q9H3R1 872 aa4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms