RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 SGK2Q9HBY8 427 aa25.19■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 FBXL12Q9NXK8 326 aa25.19■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 SLC25A13Q9UJS0 675 aa25.19■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ITIH6Q6UXX5 1313 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 FAM47DPA6NHR8 397 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 FSBPO95073 299 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ADCY5O95622 1261 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF18P17022 549 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 PMLP29590 882 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 CXCR3P49682 368 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 NOMO3P69849 1222 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ARID5BQ14865 1188 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 SYCP1Q15431 976 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 CST6Q15828 149 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 SLC25A52Q3SY17 297 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 C9orf64Q5T6V5 341 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 NEK11Q8NG66 645 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 OMDQ99983 421 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.18■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 MID1O15344 667 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 CLDN11O75508 207 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 STAT1P42224 750 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 PSMD8P48556 350 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 IRAK1P51617 712 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 CDR2Q01850 454 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 UBXN1Q04323 297 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 SEMA3BQ13214 749 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ACCSLQ4AC99 568 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 LRRC31Q6UY01 552 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 USP30Q70CQ3 517 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 C14orf80Q86SX3 495 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 MUC3BQ9H195 1237 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM51Q9NW97 253 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 VPS28Q9UK41 221 aa25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 NUMA1Q14980 2115 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 A0A1W2PP55 124 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 LGALS16A8MUM7 142 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 EPHB6O15197 1021 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 FLT3P36888 993 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 PLK1P53350 603 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 CDH4P55283 916 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 FOXC1Q12948 553 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 STK40Q8N2I9 435 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 CFAP57Q96MR6 1250 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ADAM33Q9BZ11 813 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.16■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 C7P10643 843 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 SLC8A1P32418 973 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 JAM2P57087 298 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 NT5C3BQ969T7 300 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 BIRC7Q96CA5 298 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 FEM1AQ9BSK4 669 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 SNX10Q9Y5X0 201 aa25.15■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 CER1O95813 267 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ADH1BP00325 375 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 IL1BP01584 269 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 RHOCP08134 193 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 RDXP35241 583 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 FMO1Q01740 532 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 TEAD4Q15561 434 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 TRIM72Q6ZMU5 477 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 PTPRN2Q92932 1015 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 ANLNQ9NQW6 1124 aa25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PRKCH-216ENST00000555542 UPK3BL1B0FP48 263 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 UPK3BL2E5RIL1 263 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 CNTN5O94779 1100 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 VAV1P15498 845 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ATP11AP98196 1134 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 TYRO3Q06418 890 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SLC14A1Q13336 389 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 KIAA0895LQ68EN5 471 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 IL27RAQ6UWB1 636 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 PIP4P1Q86T03 277 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 EMC1Q8N766 993 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 OR52K2Q8NGK3 314 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 NEUROG2Q9H2A3 272 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 GAREM1Q9H706 876 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa25.13■■□□□ 1.61
PRKCH-216ENST00000555542 SERGEFQ9UGK8 458 aa25.13■■□□□ 1.61
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