RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876		A6NLC8	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ANP32C	O43423	234 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TNNT1	P13805	278 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TUB	P50607	506 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RRH	O14718	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	LIFR	P42702	1097 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF84	P51523	738 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SHC2	P98077	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	GPR162	Q16538	588 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	PEX12	O00623	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	PPEF2	O14830	753 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	CNTN5	O94779	1100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	LYL1	P12980	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ELF1	P32519	619 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	KRT9	P35527	623 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	PGM1	P36871	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	DMWD	Q09019	674 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	RABEP1	Q15276	862 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	DSCR3	O14972	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	RNF8	O76064	485 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM23-208	ENST00000553876	TGM2	P21980	687 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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