RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553843.5

RHOXF1-AS1-201, RHOXF1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RHOXF1-AS1, Length 2,102 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CCDC66A2RUB6 948 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SPOPO43791 374 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TACR2P21452 398 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CTNNA2P26232 953 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CCR1P32246 355 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GGCXP38435 758 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CXCL12P48061 93 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MARCKSL1P49006 195 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CCR3P51677 355 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ATP11AP98196 1134 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CUL1Q13616 776 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EMC10Q5UCC4 262 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 LGI2Q8N0V4 545 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CFAP52Q8N1V2 620 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ZBTB9Q96C00 473 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 BTBD6Q96KE9 485 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RRN3Q9NYV6 651 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 VPS18Q9P253 973 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa8.39□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 AGPSO00116 658 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM153BP0C7A2 387 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CISD3P0C7P0 127 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SP9P0CG40 484 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SLC2A3P11169 496 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 KRT3P12035 628 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PDGFRAP16234 1089 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RRM1P23921 792 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HOXC13P31276 330 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SDC4P31431 198 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RPS24P62847 133 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TRADDQ15628 312 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM153CQ494X1 144 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RAB6CQ53S08 254 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MS4A13Q5J8X5 152 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PIK3R6Q5UE93 754 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MREGQ8N565 214 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ALLCQ8N6M5 410 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 C3orf20Q8ND61 904 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 USP33Q8TEY7 942 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 AZIN2Q96A70 460 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MCEEQ96PE7 176 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 WDCPQ9H6R7 721 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 FAM153AQ9UHL3 310 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ADAM21Q9UKJ8 722 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PRRT4C9JH25 899 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 F5H5T6 163 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GFRA2O00451 464 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TTI1O43156 1089 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ATG13O75143 517 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GPD1P21695 349 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 WASP42768 502 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 TNFRSF4P43489 277 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GYS2P54840 703 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 PPP2R5DQ14738 602 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 GEN1Q17RS7 908 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 CCDC14Q49A88 953 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 ALS2CLQ60I27 953 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 AADACL2Q6P093 401 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 DCUN1D2Q6PH85 259 aa8.38□□□□□ -1.07
RHOXF1-AS1-201ENST00000553843 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms