RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125		B9A039	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RHOD	O00212	210 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	GSTM2	P28161	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	STAT1	P42224	750 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	MIDN	Q504T8	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	DERA	Q9Y315	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	SYN3	O14994	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	LYL1	P12980	280 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ACP5	P13686	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	PRF1	P14222	555 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	CHRNA5	P30532	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	PNPLA4	P41247	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	MTX1	Q13505	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	KAT2A	Q92830	837 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	COG8	Q96MW5	612 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	STX16	O14662	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	MOSPD3	O75425	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	CSF1	P09603	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	PTGER1	P34995	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ME1	P48163	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	PMPCA	Q10713	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	BIRC3	Q13489	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	SOCS2	O14508	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	HLA-DQA2	P01906	255 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MDM2-231	ENST00000544125	WNT1	P04628	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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