RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CYP2C18P33260 490 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCL14Q16627 93 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ASB8Q9H765 288 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ACOT9Q9Y305 439 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DERAQ9Y315 318 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NR2E1Q9Y466 385 aa9.65□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC189A1A4V9 331 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 BTN3A1O00481 513 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 INPP4BO15327 924 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ATP9AO75110 1047 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GSTM1P09488 218 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DLG4P78352 724 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LUZP2Q86TE4 346 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CDK20Q8IZL9 346 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SH3BGRLO75368 114 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KRT33AO76009 404 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 EPHX1P07099 455 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CTPS1P17812 591 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PEX5P50542 639 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RGS1Q08116 209 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GNA13Q14344 377 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FBXO39Q8N4B4 442 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SGSM3Q96HU1 749 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NAT9Q9BTE0 207 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NMRAL1Q9HBL8 299 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM114B3SHH9 223 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GUCY1B2O75343 617 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GJB6O95452 261 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FTH1P02794 183 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KELP23276 732 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CYP3A7P24462 503 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINB5P36952 375 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HPCAL1P37235 193 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 COMMD2Q86X83 199 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 KRT84Q9NSB2 600 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ARL15Q9NXU5 204 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ISM1B1AKI9 464 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NR5A2O00482 541 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CCDC159P0C7I6 412 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NTSP30990 170 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MGAT5Q09328 741 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FAAH2Q6GMR7 532 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FUT10Q6P4F1 479 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CRTC3Q6UUV7 619 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 FAM35AQ86V20 835 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ISCUQ9H1K1 167 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 WHRNQ9P202 907 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 IRS2Q9Y4H2 1338 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 RASSF10A6NK89 507 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 H3BMM5 538 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GNSP15586 552 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MIPP30301 263 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 LBX1P52954 281 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 GUCY1A3Q02108 690 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NFYCQ13952 458 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 NR6A1Q15406 480 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 CARD9Q9H257 536 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 OR10H2O60403 315 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ALPPL2P10696 532 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ERFP50548 548 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-204ENST00000538708 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms