RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534166.1

EPB41L2-231, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1 like 2, human

TSL 3

Gene EPB41L2, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EPB41L2-231	ENST00000534166	FLT3LG	P49771	235 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	TKTL1	P51854	596 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	CORO7	P57737	925 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	SP3	Q02447	781 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ADIG	Q0VDE8	80 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	GRIK3	Q13003	919 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	TUSC3	Q13454	348 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	PRPSAP1	Q14558	356 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	KCNA10	Q16322	511 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	FYB2	Q5VWT5	728 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	WSCD1	Q658N2	575 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	DEFB106A	Q8N104	65 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	RNF169	Q8NCN4	708 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	MCU	Q8NE86	351 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	CPT1B	Q92523	772 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	PMEPA1	Q969W9	287 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	MTBP	Q96DY7	904 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	GAD1	Q99259	594 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ACBD6	Q9BR61	282 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	NAT9	Q9BTE0	207 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	TRABD	Q9H4I3	376 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	CLUH	O75153	1309 aa		6.68	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166		A0A0U1RQF3	1178 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	HMX2	A2RU54	273 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ARL5C	A6NH57	179 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166		E7ESA3	106 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	PPEF2	O14830	753 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	TM9SF1	O15321	606 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	OPHN1	O60890	802 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	NEBL	O76041	1014 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	B3GAT3	O94766	335 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	PGK1	P00558	417 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	TGFB1	P01137	390 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	IGLV1-40	P01703	118 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	APRT	P07741	180 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	CD48	P09326	243 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	CTSH	P09668	335 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	GHR	P10912	638 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	COL6A1	P12109	1028 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	MLN	P12872	115 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	EDN3	P14138	238 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	TPSB2	P20231	275 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	CA4	P22748	312 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	CNTF	P26441	200 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	HTR7	P34969	479 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	GRIK1	P39086	918 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	IFNAR2	P48551	515 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	SERPINB9	P50453	376 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	HDAC4	P56524	1084 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	MAP3K7CL	P57077	242 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	IFT88	Q13099	833 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	NME3	Q13232	169 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	MTA1	Q13330	715 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ITGA7	Q13683	1181 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	TPSAB1	Q15661	275 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	PARP6	Q2NL67	630 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ABI1	Q8IZP0	508 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	FUK	Q8N0W3	1084 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	SCML4	Q8N228	414 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	CCNY	Q8ND76	341 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	MDM1	Q8TC05	714 aa		6.67	□□□□□ -1.34
EPB41L2-231	ENST00000534166	RAET1E	Q8TD07	263 aa		6.67	□□□□□ -1.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms