RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530368.1

RRM1-208, Transcript of ribonucleotide reductase catalytic subunit M1, human

TSL 5

Gene RRM1, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM1-208	ENST00000530368	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SYN3	O14994	580 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ANP32C	O43423	234 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	MVD	P53602	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ADPRH	P54922	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TUBA4A	P68366	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	MTA1	Q13330	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	IP6K1	Q92551	441 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	PIGK	Q92643	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	MROH8	Q9H579	483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	PLAU	P00749	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	AKR1A1	P14550	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	CD72	P21854	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TACR3	P29371	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	MPP1	Q00013	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	GALNT2	Q10471	571 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	INPPL1	O15357	1258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	METTL18	O95568	372 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	CD4	P01730	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	CYP4B1	P13584	511 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TYK2	P29597	1187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	PGM1	P36871	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	RALBP1	Q15311	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	NFIL3	Q16649	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	DPF1	Q92782	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	RNF8	O76064	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	MBD4	O95243	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	TNNT1	P13805	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RRM1-208	ENST00000530368	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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