RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530267.5

USP35-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 35, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP35, Length 2,419 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35-204ENST00000530267 PAGE1O75459 146 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ITGA2BP08514 1039 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 T-ENOLP0DO92 83 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 SERPINB3P29508 390 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 NUMBP49757 651 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 SP3Q02447 781 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CERS2Q96G23 380 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 C20orf27Q9GZN8 174 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 GBA3Q9H227 469 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 BFARQ9NZS9 450 aa15.5■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 DLDP09622 509 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 MYL2P10916 166 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CRHR1P34998 444 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 NKX3-2P78367 333 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ZBTB16Q05516 673 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 E2F5Q15329 346 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CMC1Q7Z7K0 106 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 SCD5Q86SK9 330 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 NOD2Q9HC29 1040 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 OSER1Q9NX31 292 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 MPP6Q9NZW5 540 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 IRAK2O43187 625 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 SOAT2O75908 522 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 KCNA4P22459 653 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ARPP19P56211 112 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CNTD1Q8N815 330 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 LINC01599Q8WXQ3 324 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ZNF778Q96MU6 729 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 UROC1Q96N76 676 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ABCC13Q9NSE7 274 aa15.49■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 TNFRSF10BO14763 440 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 SKIP12755 728 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 KCTD11Q693B1 232 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CYS1Q717R9 158 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 TTC7BQ86TV6 843 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CCNJLQ8IV13 435 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 TTC9BQ8N6N2 239 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 TEKT5Q96M29 485 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 GLT1D1Q96MS3 346 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 RGS18Q9NS28 235 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ZNF358Q9NW07 568 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 TYK2P29597 1187 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CCR1P32246 355 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 NOMO2Q5JPE7 1267 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 SLC24A5Q71RS6 500 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 STRA8Q7Z7C7 330 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ATPAF2Q8N5M1 289 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 NAT9Q9BTE0 207 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CAB39LQ9H9S4 337 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 NEU3Q9UQ49 428 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 RAD54BQ9Y620 910 aa15.48■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 NLRC5Q86WI3 1866 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 IGLV3-25P01717 112 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 BPGMP07738 259 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CNTFP26441 200 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 PGGT1BP53609 377 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 CASS4Q9NQ75 786 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 TBC1D13Q9NVG8 400 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ARMCX1Q9P291 453 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 HCSTQ9UBK5 93 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 TRHDEQ9UKU6 1024 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 EMCNQ9ULC0 261 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 PTPRDP23468 1912 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 TUBP50607 506 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 USP46P62068 366 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 FAM26DQ5JW98 314 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 ATG16L1Q676U5 607 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.47■□□□□ 0.07
USP35-204ENST00000530267 C14orf80Q86SX3 495 aa15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms