RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529766.5

BBS1-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 1,590 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-215	ENST00000529766	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CHST9	Q7L1S5	443 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	NETO2	Q8NC67	525 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	BBOF1	Q8ND07	529 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	FATE1	Q969F0	183 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	P2RY11	Q96G91	374 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	IGFLR1	Q9H665	355 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	PIDD1	Q9HB75	910 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	TDP1	Q9NUW8	608 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	LINC01565	O15544	149 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	MTSS1	O43312	755 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	MAFK	O60675	156 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CLDN11	O75508	207 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CEBPB	P17676	345 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	NRL	P54845	237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	COL19A1	Q14993	1142 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	EMB	Q6PCB8	327 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ITFG1	Q8TB96	612 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	PAK5	Q9P286	719 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CHKA	P35790	457 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	SGSH	P51688	502 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CAV1	Q03135	178 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	GPS1	Q13098	491 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	MAP9	Q49MG5	647 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CCNY	Q8ND76	341 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CAVIN3	Q969G5	261 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CLEC1B	Q9P126	229 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		13.59	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766		A0A0A0MRY4	1105 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766		A0A1B0GVM2	712 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	RASA4B	C9J798	803 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	NDC80	O14777	642 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	RASA4	O43374	803 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	PRAMEF12	O95522	483 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	FAM153B	P0C7A2	387 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	OR1E1	P30953	314 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	MAGEA6	P43360	314 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	VPS41	P49754	854 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	PLTP	P55058	493 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	AP1B1	Q10567	949 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CALCOCO2	Q13137	446 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF77	Q15935	545 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	PARP15	Q460N3	678 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	FAM153C	Q494X1	144 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		13.58	□□□□□ -0.23
BBS1-215	ENST00000529766	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23

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