RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525809.5

BBS1-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 601 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-208	ENST00000525809	BECN2	A8MW95	431 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	IL1B	P01584	269 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	PDGFRA	P16234	1089 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	PON1	P27169	355 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	CD38	P28907	300 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	KRT9	P35527	623 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	PSMD8	P48556	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	BPIFB4	P59827	614 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	FBXL22	Q6P050	247 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	MLKL	Q8NB16	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	SHC3	Q92529	594 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	SLC6A18	Q96N87	628 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.63	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809		A0A1W2PR77	199 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	C10orf142	B7Z368	130 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TLR4	O00206	839 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	YKT6	O15498	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	SLC7A4	O43246	635 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ATP9B	O43861	1147 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	CLDN11	O75508	207 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	GRAP2	O75791	330 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ITGAV	P06756	1048 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	CDK4	P11802	303 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	NOS2	P35228	1153 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	NUDT1	P36639	197 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	UBE2H	P62256	183 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	SLC6A3	Q01959	620 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	CAMK4	Q16566	473 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ACCSL	Q4AC99	568 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	LAYN	Q6UX15	382 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ALG14	Q96F25	216 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	CPXM1	Q96SM3	734 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	SYNC	Q9H7C4	482 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	EBF2	Q9HAK2	575 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	GDF3	Q9NR23	364 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	RRN3	Q9NYV6	651 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	COX16	Q9P0S2	106 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		10.62	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	USP24	Q9UPU5	2620 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809		M0QYT0	321 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	MAGEC1	O60732	1142 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	F9	P00740	461 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	WNT1	P04628	370 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ZNF18	P17022	549 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	CLCN1	P35523	988 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	RXRG	P48443	463 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	ADPRH	P54922	357 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	CDH4	P55283	916 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	APBA1	Q02410	837 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	NME3	Q13232	169 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	KCNJ12	Q14500	433 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	DLG2	Q15700	870 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	C5orf22	Q49AR2	442 aa		10.61	□□□□□ -0.71
BBS1-208	ENST00000525809	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71

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