RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515712.1

ACTBP2-201, Transcript of actin, beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP2, Length 1,123 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP2-201ENST00000515712 C3orf20Q8ND61 904 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 SNX19Q92543 992 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 TCEAL3Q969E4 200 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 NT5C3BQ969T7 300 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 SGK2Q9HBY8 427 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 CD248Q9HCU0 757 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 PRSS16Q9NQE7 514 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 TMEM59LQ9UK28 342 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 THADAQ6YHU6 1953 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 A0A1B0GTH6 734 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 LNP1A1A4G5 178 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 LRRC72A6NJI9 287 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 E9PAM4 449 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 SIN3BO75182 1162 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ADCY5O95622 1261 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 IL1BP01584 269 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 SERPINF2P08697 491 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 CHRNB2P17787 502 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 OR1E1P30953 314 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 PTPN9P43378 593 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 MAPK8P45983 427 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 PLK1P53350 603 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 GSCP56915 257 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ARID5BQ14865 1188 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 TEAD4Q15561 434 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 USP30Q70CQ3 517 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 EMC1Q8N766 993 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 OR8D1Q8WZ84 308 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 IGSF8Q969P0 613 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 SKA1Q96BD8 255 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 TRIM11Q96F44 468 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 VCPIP1Q96JH7 1222 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 SLC32A1Q9H598 525 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 RETREG1Q9H6L5 497 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 FBXL12Q9NXK8 326 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 DONSONQ9NYP3 566 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 HPCAL4Q9UM19 191 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 EML5Q05BV3 1969 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ITIH6Q6UXX5 1313 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 A0A1B0GTW7 788 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 LRRC53A6NM62 1247 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 C4orf47A7E2U8 309 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 TTC34A8MYJ7 566 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 TEX33O43247 280 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 SEMA4FO95754 770 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 IGLV3-19P01714 112 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ENGP17813 658 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 GGCXP38435 758 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 UBASH3AP57075 661 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 RPS14P62263 151 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 NFKBIBQ15653 356 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 CST6Q15828 149 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 UAP1L1Q3KQV9 507 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 PPM1JQ5JR12 505 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 EFHC2Q5JST6 749 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 DCAF12L1Q5VU92 463 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 RETSATQ6NUM9 610 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 SCYL2Q6P3W7 929 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 APCDD1Q8J025 514 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 MYEOVQ96EZ4 313 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 FEM1AQ9BSK4 669 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 CBX8Q9HC52 389 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 DYRK4Q9NR20 520 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 PARVAQ9NVD7 372 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTBP2-201ENST00000515712 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms