RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 VAV1P15498 845 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 GOT1P17174 413 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 ABCB4P21439 1286 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 C5AR1P21730 350 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 CCR1P32246 355 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 NNMTP40261 264 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 GRK6P43250 576 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 SLC12A1Q13621 1099 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 EXOC3L4Q17RC7 722 aa17.45■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 RNF34Q969K3 372 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 SLC2A13Q96QE2 648 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1468Q9P260 1216 aa17.45■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa17.45■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 PON1P27169 355 aa17.44■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 CENPCQ03188 943 aa17.44■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 SULT2A1Q06520 285 aa17.44■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 IRF2BP1Q8IU81 584 aa17.44■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 WNT9AO14904 365 aa17.43■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 MDM1Q8TC05 714 aa17.43■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 SKA1Q96BD8 255 aa17.43■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 NOX5Q96PH1 765 aa17.43■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 VANGL2Q9ULK5 521 aa17.43■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 OR52K2Q8NGK3 314 aa17.42■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 ALG14Q96F25 216 aa17.42■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 FEM1AQ9BSK4 669 aa17.42■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 SIX2Q9NPC8 291 aa17.42■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 DNAJC12Q9UKB3 198 aa17.42■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 HS3ST4Q9Y661 456 aa17.42■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa17.41■□□□□ 0.38
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HERC3-211ENST00000513325 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D3EA0A087X179 549 aa17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PR77 199 aa17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 TBC1D3LB9A6J9 549 aa17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 M0QYT0 321 aa17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
HERC3-211ENST00000513325 PAGE1O75459 146 aa17.41■□□□□ 0.38
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