RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 TTC17Q96AE7 1141 aa16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 LMLNQ96KR4 655 aa16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 EPB41L5Q9HCM4 733 aa16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 PANK4Q9NVE7 773 aa16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 DMTF1Q9Y222 760 aa16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 USP3Q9Y6I4 520 aa16.11■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 A1L4Q6 167 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 NEMP2A6NFY4 417 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 UGT1A5P35504 534 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 ALCAMQ13740 583 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 DEFB133Q30KQ1 61 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 OR6B2Q6IFH4 312 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 SPOPLQ6IQ16 392 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 MFN1Q8IWA4 741 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 PTPRN2Q92932 1015 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 USP29Q9HBJ7 922 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 SARDHQ9UL12 918 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 CELSR2Q9HCU4 2923 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa16.1■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 VNN1O95497 513 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 LIPCP11150 499 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 SLC6A4P31645 630 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 KCNAB2Q13303 367 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 NCOA4Q13772 614 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 ADGRF1Q5T601 910 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 TRIM69Q86WT6 500 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 MYEOVQ96EZ4 313 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 DUSP23Q9BVJ7 150 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 VRTNQ9H8Y1 702 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 PNPLA8Q9NP80 782 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 PPP4R2Q9NY27 417 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 PISDQ9UG56 409 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 CEP83Q9Y592 693 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa16.09■□□□□ 0.17
ALYREF-204ENST00000512673 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 TCEA3O75764 348 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 RNF224P0DH78 156 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 COL8A1P27658 744 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 POLE2P56282 527 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 CNTN1Q12860 1018 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 MORC3Q14149 939 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 SPIDRQ14159 915 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 FSCBQ5H9T9 825 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 AGBL4Q5VU57 503 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 SV2BQ7L1I2 683 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 CARNMT1Q8N4J0 409 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 EDEM1Q92611 657 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.08■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 MTSS1O43312 755 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 ASLP04424 464 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 ITIH1P19827 911 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 UQCRFS1P47985 274 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 PHF12Q96QT6 1004 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 ADNPQ9H2P0 1102 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.07■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 SCN8AQ9UQD0 1980 aa16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 A0A1W2PQU0 124 aa16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 TGFB1I1O43294 461 aa16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 STX6O43752 255 aa16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 PRAMEF10O60809 474 aa16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 AGFG2O95081 481 aa16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 NUDT1P36639 197 aa16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 ASPAP45381 313 aa16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 TAS2R38P59533 333 aa16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ALYREF-204ENST00000512673 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms