RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM24O15164 1050 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ARHGAP6O43182 974 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CREB3O43889 395 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SP9P0CG40 484 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 COL9A1P20849 921 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 HOXC13P31276 330 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CD70P32970 193 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CSKP41240 450 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF5AQ12840 1032 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ENPP2Q13822 863 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GAS6Q14393 721 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF234Q14588 700 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PDK2Q15119 407 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA1328Q86T90 577 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 LONP2Q86WA8 852 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 LMLNQ96KR4 655 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC114Q96M63 670 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TSGA10Q9BZW7 698 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIOO75962 3097 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RAMP2O60895 175 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF217O75362 1048 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CLCN6P51797 869 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SATB1Q01826 763 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GNA12Q03113 381 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT81Q14533 505 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MESDQ14696 234 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DPYSL2Q16555 572 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PARP15Q460N3 678 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FSCBQ5H9T9 825 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC38Q5VT99 294 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR5BQ86VZ2 330 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 VSIG1Q86XK7 387 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MPP6Q9NZW5 540 aa14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 I6L893 689 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SGK1O00141 431 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 AXIN1O15169 862 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CNTN5O94779 1100 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPINB6P35237 376 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 GGCXP38435 758 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 VAV2P52735 878 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NDST2P52849 883 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB16Q05516 673 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MESP2Q0VG99 397 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA3BQ13214 749 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 FUT11Q495W5 492 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ALFQ53S48 1182 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 EMC10Q5UCC4 262 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 IL31Q6EBC2 164 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RFX8Q6ZV50 586 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 DSG4Q86SJ6 1040 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 KCTD6Q8NC69 237 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MYEOVQ96EZ4 313 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM7Q9C029 511 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SCML1Q9UN30 329 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.92□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF487B1APH4 448 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 K7ESF4 209 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 SPOPO43791 374 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 EPHX1P07099 455 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RARAP10276 462 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM215Q68D42 235 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 NLRP14Q86W24 1093 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 RASSF3Q86WH2 238 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.91□□□□□ -0.02
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms