RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 WSCD1Q658N2 575 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ICE2Q659A1 982 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SCARA3Q6AZY7 606 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 RHBDF2Q6PJF5 856 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNT2Q6UVM3 1135 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 MON1BQ7L1V2 547 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACOT1Q86TX2 421 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC25Q86WR0 208 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ERICH1Q86X53 443 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC13Q8IYE1 715 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 KATNAL2Q8IYT4 538 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CRYBG2Q8N1P7 616 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC4A11Q8NBS3 891 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATL2Q8NHH9 583 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 HASPINQ8TF76 798 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CPA5Q8WXQ8 436 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 HERVK_113Q902F9 699 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM169Q96HH4 297 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CITED4Q96RK1 184 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC9A7Q96T83 725 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACBD6Q9BR61 282 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAAF1Q9BRP4 392 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 FOXP3Q9BZS1 431 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SPG21Q9NZD8 308 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJB4Q9UDY4 337 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANAPC5Q9UJX4 755 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDH9Q9ULB4 789 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 BRCA2P51587 3418 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 I3L4J1 428 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 M0QYV0 167 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SYN3O14994 580 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PAGE1O75459 146 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 TCEA3O75764 348 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 GJB5O95377 273 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 LSM8O95777 96 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CALCAP01258 141 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CALB1P05937 261 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 DESP17661 470 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 LMO2P25791 158 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARNTP27540 789 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CA8P35219 290 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPM1AP35813 382 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADCY8P40145 1251 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLCO1A2P46721 670 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC11A1P49279 550 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 GATMP50440 423 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ITGA8P53708 1063 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAS2R40P59535 323 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 NOMO3P69849 1222 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 DEFB103AP81534 67 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPARDQ03181 441 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 LMNB2Q03252 620 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 LONRF1Q17RB8 773 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 FBLN7Q53RD9 439 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 FYB2Q5VWT5 728 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 IZUMO3Q5VZ72 239 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 LCLAT1Q6UWP7 414 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 C4orf50Q6ZRC1 276 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ANKS3Q6ZW76 656 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMC7Q7Z402 723 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PKD1L2Q7Z442 2459 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 LRRC34Q8IZ02 419 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBR7Q8N806 425 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC89Q8N998 374 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 EXD1Q8NHP7 514 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 UBA3Q8TBC4 463 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 DYDC1Q8WWB3 177 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ATG4AQ8WYN0 398 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC77Q9BR77 488 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 C11orf70Q9BRQ4 267 aa5.78□□□□□ -1.48
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTPALQ9BTX7 342 aa5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms