RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492973.1

TPR-208, Transcript of translocated promoter region, nuclear basket protein, humanhuman

TSL 2

Gene TPR, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPR-208ENST00000492973 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 WDR49Q8IV35 697 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 DRC7Q8IY82 874 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 NXPE1Q8N323 547 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 HIPK4Q8NE63 616 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 HASPINQ8TF76 798 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 COLEC11Q9BWP8 271 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 DPP3Q9NY33 737 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 SIK3Q9Y2K2 1263 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.31□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 I3L4J1 428 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 PMM2O15305 246 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 XPOTO43592 962 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 TADA2AO75478 443 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 B3GAT3O94766 335 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 VNN1O95497 513 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 TNNC2P02585 160 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 CYP17A1P05093 508 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 TMEM191BP0C7N4 346 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 TNNI1P19237 187 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 SLC9A1P19634 815 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 BRCC3P46736 316 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 GCLMP48507 274 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 FMO5P49326 533 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.242e-7■□□□□ 9.5
TPR-208ENST00000492973 KLK7P49862 253 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 RBP5P82980 135 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 SYCP1Q15431 976 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ZACNQ401N2 412 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 KANK2Q63ZY3 851 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 FUT10Q6P4F1 479 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 DEFB123Q8N688 67 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 POF1BQ8WVV4 589 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 C16orf92Q96LL3 132 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 GUCD1Q96NT3 240 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 FNBP1Q96RU3 617 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 MTMR10Q9NXD2 777 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ADAM28Q9UKQ2 775 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 LZTS1Q9Y250 596 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.3□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 P4HA2O15460 535 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 NOL4O94818 638 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ITGB3P05106 788 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 PON1P27169 355 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 GTF2H1P32780 548 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 AP3M2P53677 418 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 LILRA4P59901 499 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 MYL6P60660 151 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 KRT17Q04695 432 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 UBE3AQ05086 875 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 NFATC3Q12968 1075 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 CBWD6Q4V339 395 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 CBWD3Q5JTY5 395 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 LCE4AQ5TA78 99 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 FAM124AQ86V42 546 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 VPS52Q8N1B4 723 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 LRRC52Q8N7C0 313 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 LMO3Q8TAP4 145 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 SEMA4DQ92854 862 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 AJUBAQ96IF1 538 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 B3GALT6Q96L58 329 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 FOXB1Q99853 325 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.29□□□□□ -1.24
TPR-208ENST00000492973 NUP58Q9BVL2 599 aa7.29□□□□□ -1.24
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