RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 AVPR2P30518 371 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 HNF1BP35680 557 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 GGT5P36269 586 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CACNA2D1P54289 1103 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 UEVLDQ8IX04 471 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 NME8Q8N427 588 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 P2RY11Q96G91 374 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 UROC1Q96N76 676 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PKP3Q9Y446 797 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM232C9JQI7 657 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 HLA-DQA2P01906 255 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 RFPL3SP0C7P2 107 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PRKG2Q13237 762 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 SLC14A1Q13336 389 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF766Q5HY98 468 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 AADACL2Q6P093 401 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 RANBP10Q6VN20 620 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ELP4Q96EB1 424 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 C5orf34Q96MH7 638 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TIGD1Q96MW7 591 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 KRT84Q9NSB2 600 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 EMSYQ7Z589 1322 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TEX22C9J3V5 150 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 HBP1O60381 514 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 GJC1P36383 396 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G5P39877 138 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PTP4A2Q12974 167 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TDGQ13569 410 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 LCE4AQ5TA78 99 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA1Q5VX52 437 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 GJB7Q6PEY0 223 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 REPS1Q96D71 796 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 EYA3Q99504 573 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP26Q9BV47 211 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 DTX4Q9Y2E6 619 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM247A6NEH6 219 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS47A8MTI9 375 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TARM1B6A8C7 271 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 USP12O75317 370 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 GCP02774 474 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CYP2D6P10635 497 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 AKR1A1P14550 325 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 POLD2P49005 469 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 DHRS13Q6UX07 377 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 RFX6Q8HWS3 928 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRC-212ENST00000491302 PI4KAP2A4QPH2 592 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 K7ENM7 598 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 CHRM4P08173 479 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 GPD1P21695 349 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF627Q7L945 461 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ZMIZ2Q8NF64 920 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 CUL5Q93034 780 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 KIF1BPQ96EK5 621 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 ARL15Q9NXU5 204 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 KCND2Q9NZV8 630 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 TLK1Q9UKI8 766 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 STRNO43815 780 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 UBL4AP11441 157 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRC-212ENST00000491302 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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