RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489853.1

SNRNP40-206, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 1,928 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	GLI3	P10071	1580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SNTN	A6NMZ2	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ASNA1	O43681	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DYRK3	O43781	588 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	B4GALT4	O60513	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PDE8B	O95263	885 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NR3C1	P04150	777 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	COX4I1	P13073	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NCAM1	P13591	858 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NR4A1	P22736	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	EPHA3	P29320	983 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PKLR	P30613	574 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NUDT1	P36639	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	HPCAL1	P37235	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FMO5	P49326	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NT5C2	P49902	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PMS2P3	Q13401	168 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TFDP1	Q14186	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FLOT2	Q14254	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	RAB39A	Q14964	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NPTX1	Q15818	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PCSK7	Q16549	785 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	INAVA	Q3KP66	663 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853		Q6ZVU0	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ARC	Q7LC44	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SERAC1	Q96JX3	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FANCE	Q9HB96	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ACP6	Q9NPH0	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	RREB1	Q92766	1687 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	CLUH	O75153	1309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853		A8MU76	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	VWA5A	O00534	786 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	AKAP10	O43572	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	GPC4	O75487	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SERPINB2	P05120	415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	KIT	P10721	976 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SLC5A1	P13866	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	FOSL1	P15407	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	ITIH1	P19827	911 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	BDNF	P23560	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	SERPINB1	P30740	379 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SNRNP40-206	ENST00000489853	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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