RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489100.5

FAM107B-223, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-223	ENST00000489100	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	USP53	Q70EK8	1073 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF276	Q8N554	614 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	SPATA20	Q8TB22	786 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	RFFL	Q8WZ73	363 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	EDEM1	Q92611	657 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	CALN1	Q9BXU9	219 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	MTG2	Q9H4K7	406 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	DYRK4	Q9NR20	520 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	RAB20	Q9NX57	234 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	IL17B	Q9UHF5	180 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	DMTF1	Q9Y222	760 aa		7.43	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	PI4KA	P42356	2102 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	TENM4	Q6N022	2769 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	CPED1	A4D0V7	1026 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	HHLA1	C9JL84	531 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	PSMA7	O14818	248 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	BNIP3L	O60238	219 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	WNT1	P04628	370 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	SFTPC	P11686	197 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	CD19	P15391	556 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	CD70	P32970	193 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	RXRG	P48443	463 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ADPRH	P54922	357 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	INHBC	P55103	352 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ECT2L	Q008S8	904 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	PROX2	Q3B8N5	592 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	MPP7	Q5T2T1	576 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	PIGZ	Q86VD9	579 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	IQCH	Q86VS3	1027 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	SEMA4D	Q92854	862 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	MYOC	Q99972	504 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	CISH	Q9NSE2	258 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A1B0GVM2	712 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100		A0A1W2PR77	199 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	TTC34	A8MYJ7	566 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100		H3BM21	787 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	TRIM38	O00635	465 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	APOE	P02649	317 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	GP1BA	P07359	652 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	THEGL	P0DJG4	465 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	KRT10	P13645	584 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	LCP1	P13796	627 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	AKT2	P31751	481 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	RPIA	P49247	311 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	RAD23B	P54727	409 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	ADIG	Q0VDE8	80 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	CUL2	Q13617	745 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	SHB	Q15464	509 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	CBWD6	Q4V339	395 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	PCSK4	Q6UW60	755 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	JAML	Q86YT9	394 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	STK40	Q8N2I9	435 aa		7.41	□□□□□ -1.22
FAM107B-223	ENST00000489100	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	7.41	□□□□□ -1.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.2 ms