RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADGRG7Q96K78 797 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 B3GNT5Q9BYG0 378 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 B3GNT4Q9C0J1 378 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 OCIAD1Q9NX40 245 aa3.07□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
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CACNA2D1-211ENST00000486539 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAREM1Q9H706 876 aa3.06□□□□□ -1.92
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CACNA2D1-211ENST00000486539 TAAR9Q96RI9 348 aa3.05□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM60Q9H2L4 133 aa3.05□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.05□□□□□ -1.92
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CACNA2D1-211ENST00000486539 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.04□□□□□ -1.92
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CACNA2D1-211ENST00000486539 CRLF1O75462 422 aa3.04□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNFSF8P32971 234 aa3.04□□□□□ -1.92
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CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC37A1P57057 533 aa3.04□□□□□ -1.92
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 OVCH2Q7RTZ1 564 aa3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGFN1Q86VF2 1251 aa3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPATA20Q8TB22 786 aa3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC8CQ8TDW0 803 aa3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa3.03□□□□□ -1.92
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFAP69A5D8W1 941 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNJ18B7U540 433 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRAC2D3DTV9 90 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 MT-ND5P03915 603 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAGAP17050 411 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 DGKAP23743 735 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATICP31939 592 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRT9P35527 623 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 NEK2P51955 445 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACCSLQ4AC99 568 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLA2G4FQ68DD2 849 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 ERAP2Q6P179 960 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRT28Q7Z3Y7 464 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM163Q8TC26 289 aa3.02□□□□□ -1.93
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD101Q93033 1021 aa3.02□□□□□ -1.93
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