RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 LMF1Q96S06 567 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 NEU1Q99519 415 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 HAUS2Q9NVX0 235 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 THEGQ9P2T0 379 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 USP22Q9UPT9 525 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 RCE1Q9Y256 329 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.13□□□□□ -1.43
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STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA31D3P0C874 917 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 UQCRC1P31930 480 aa6.13□□□□□ -1.43
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STRADBP1-201ENST00000478954 MTHFSP49914 203 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAM17P78536 824 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 CSHL1Q14406 222 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR68Q15743 365 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SLFN13Q68D06 897 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 TMCO3Q6UWJ1 677 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 VPS28Q9UK41 221 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PIAS3Q9Y6X2 628 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 RTL9Q8NET4 1388 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ABCC12Q96J65 1359 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 NUP98P52948 1817 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 LTBP2Q14767 1821 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 OTOFQ9HC10 1997 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SMIM22K7EJ46 135 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 M0QYT0 321 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 P4HA2O15460 535 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SUN1O94901 812 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 GLULP15104 373 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ALOX12P18054 663 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ADORA2AP29274 412 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 CTGFP29279 349 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
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STRADBP1-201ENST00000478954 GATMP50440 423 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 RAC3P60763 192 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF844Q08AG5 666 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 CFAP58Q5T655 872 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM205AQ6ZU69 1335 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 TIGD1Q96MW7 591 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 HAPLN3Q96S86 360 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 FUZQ9BT04 418 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ITPAQ9BY32 194 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 FZD1Q9UP38 647 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 TRANK1O15050 2925 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 TOR1BO14657 336 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 FYB1O15117 783 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXS1O43638 330 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 LARGE1O95461 756 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 DNTTP04053 509 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
STRADBP1-201ENST00000478954 PBX1P40424 430 aa6.11□□□□□ -1.43
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