RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 CLEC4CQ8WTT0 213 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 THAP4Q8WY91 577 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 TM2D2Q9BX73 214 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 USP29Q9HBJ7 922 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 FEM1BQ9UK73 627 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 NFU1Q9UMS0 254 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 VPS4AQ9UN37 437 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 NCOA2Q15596 1464 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa3.45□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 PREX2Q70Z35 1606 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 C17orf100A8MU93 164 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SMIM22K7EJ46 135 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 PPP6CO00743 305 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 LARGE1O95461 756 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SEMA3AQ14563 771 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 TAF5Q15542 800 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 DENND2CQ68D51 928 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 RANBP10Q6VN20 620 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 NEK8Q86SG6 692 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 WDR60Q8WVS4 1066 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ATP2A3Q93084 1043 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ASB2Q96Q27 587 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.44□□□□□ -1.86
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TRBV1-201ENST00000476502 KCND3Q9UK17 655 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 RAB21Q9UL25 225 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa3.44□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ARHGAP23Q9P227 1491 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa3.43□□□□□ -1.86
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TRBV1-201ENST00000476502 ARL4CP56559 192 aa3.43□□□□□ -1.86
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TRBV1-201ENST00000476502 CUL4BQ13620 913 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
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TRBV1-201ENST00000476502 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 TIGD6Q17RP2 521 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 CEP78Q5JTW2 689 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 SLC18B1Q6NT16 456 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 C11orf87Q6NUJ2 197 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM65Q6PI78 240 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 BRINP3Q76B58 766 aa3.43□□□□□ -1.86
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TRBV1-201ENST00000476502 ZNF354CQ86Y25 554 aa3.43□□□□□ -1.86
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TRBV1-201ENST00000476502 GPR78Q96P69 363 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 WACQ9BTA9 647 aa3.43□□□□□ -1.86
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TRBV1-201ENST00000476502 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.43□□□□□ -1.86
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TRBV1-201ENST00000476502 ELOVL5Q9NYP7 299 aa3.43□□□□□ -1.86
TRBV1-201ENST00000476502 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
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