RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 LRRC3Q9BY71 257 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 EURLQ9NYK6 297 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 YIPF1Q9Y548 306 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 INSL6Q9Y581 213 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 IRAK3Q9Y616 596 aa9.94□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 A0A0A0MRY4 1105 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 LCHNA4D1U4 455 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 C2CD2LO14523 706 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 NCAM2O15394 837 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CACNG3O60359 315 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 C1QAP02745 245 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ABHD2P08910 425 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 SLC2A3P11169 496 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 MAGEA4P43358 317 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 TBX4P57082 545 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PTSQ03393 145 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF33AQ06730 810 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 EFEMP1Q12805 493 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 SEMA5AQ13591 1074 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PDK1Q15118 436 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 KYNUQ16719 465 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 MS4A13Q5J8X5 152 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 FIBCD1Q8N539 461 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CCDC33Q8N5R6 958 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 MCUQ8NE86 351 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CCDC110Q8TBZ0 833 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 TLCD1Q96CP7 247 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 HDAC11Q96DB2 347 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 P2RY11Q96G91 374 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 SPATA13Q96N96 652 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 RAD9AQ99638 391 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 MARCH2Q9P0N8 246 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 STK39Q9UEW8 545 aa9.93□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CLUHO75153 1309 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 E9PAM4 449 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 TLR5O60602 858 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 OLFM2O95897 454 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PEX11BO96011 259 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 F11P03951 625 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 URODP06132 367 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CSH1P0DML2 217 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CSH2P0DML3 217 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 TPSB2P20231 275 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PTPN3P26045 913 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 EPHB2P29323 1055 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 SOX11P35716 441 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 BMPR1AP36894 532 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 TUBP50607 506 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 IRAK1P51617 712 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 GPX6P59796 221 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ERVFC1P60507 584 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 GPS2Q13227 327 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 AUHQ13825 339 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CAMK1Q14012 370 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 TPSAB1Q15661 275 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF567Q8N184 647 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 AZIN2Q96A70 460 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 PGM2Q96G03 612 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.92□□□□□ -0.82
ITGA6-210ENST00000475302 RNF38Q9H0F5 515 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms