RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SLC12A1	Q13621	1099 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NR1I3	Q14994	352 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RAB6C	Q53S08	254 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RNF43	Q68DV7	783 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	IL31	Q6EBC2	164 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf20	Q8ND61	904 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NETO1	Q8TDF5	533 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NT5C3B	Q969T7	300 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TTC17	Q96AE7	1141 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	EDEM2	Q9BV94	578 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MPP6	Q9NZW5	540 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MYO6	Q9UM54	1294 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SIN3B	O75182	1162 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TPM3	P06753	285 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CDH4	P55283	916 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PTP4A2	Q12974	167 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC14	Q49A88	953 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ALF	Q53S48	1182 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MON1B	Q7L1V2	547 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SYT12	Q8IV01	421 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	LMLN	Q96KR4	655 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TSPY26P	Q9H489	355 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880		I6L893	689 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RRM1	P23921	792 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MAOB	P27338	520 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	OXTR	P30559	389 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	OR1E1	P30953	314 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MAPK8	P45983	427 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PSMD8	P48556	350 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SULT2A1	Q06520	285 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	WDR59	Q6PJI9	974 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ARC	Q7LC44	396 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	DRC7	Q8IY82	874 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RNF214	Q8ND24	703 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	HAPLN3	Q96S86	360 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SPON2	Q9BUD6	331 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NUP58	Q9BVL2	599 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	FBRS	Q9HAH7	460 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM51	Q9NW97	253 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CACNA1E	Q15878	2313 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	KNL1	Q8NG31	2342 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	CCP110	O43303	1012 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PTPN9	P43378	593 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	RPS14	P62263	151 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	KRT83	P78385	493 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	NFKBIB	Q15653	356 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	STRADA	Q7RTN6	431 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms