RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ZNF366	Q8N895	744 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	RUBCN	Q92622	972 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	NTAN1	Q96AB6	310 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	TTC17	Q96AE7	1141 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	NUP85	Q9BW27	656 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	VPS28	Q9UK41	221 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		18.26	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	GABRG2	P18507	467 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ECT2L	Q008S8	904 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PTPRN	Q16849	979 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	RASSF3	Q86WH2	238 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	GAB3	Q8WWW8	586 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	HINFP	Q9BQA5	517 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	EPC1	Q9H2F5	836 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	FZD10	Q9ULW2	581 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ZNF292	O60281	2723 aa		18.25	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	FAM72C	H0Y354	149 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	CREB3	O43889	395 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PRPSAP2	O60256	369 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	LRIG2	O94898	1065 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	CYP1A2	P05177	515 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	NNMT	P40261	264 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	H2AFV	Q71UI9	128 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	FAM72B	Q86X60	149 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	TC2N	Q8N9U0	490 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	RLN3	Q8WXF3	142 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	TMEM245	Q9H330	911 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		18.24	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	DCLK1	O15075	740 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	NDUFV2	P19404	249 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MIP	P30301	263 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PLK1	P53350	603 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	AIF1	P55008	147 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SULT2A1	Q06520	285 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SCAP	Q12770	1279 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ENPP2	Q13822	863 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	CACUL1	Q86Y37	369 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	BTBD6	Q96KE9	485 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SPACA7	Q96KW9	195 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	EPAS1	Q99814	870 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SPON2	Q9BUD6	331 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	NCDN	Q9UBB6	729 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SUN2	Q9UH99	717 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	NUP205	Q92621	2012 aa		18.23	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MYO1F	O00160	1098 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MAP3K13	O43283	966 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	EPHB2	P29323	1055 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	L1CAM	P32004	1257 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	KRT83	P78385	493 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ACCSL	Q4AC99	568 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
USP19-210	ENST00000465902	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		18.22	■□□□□ 0.51

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