RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465120.3

HOXB3-204, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB3, Length 943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-204ENST00000465120 SKA1Q96BD8 255 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 PPP1R9BQ96SB3 815 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 NDST4Q9H3R1 872 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 OSGEPQ9NPF4 335 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 SERGEFQ9UGK8 458 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 DACH1Q9UI36 760 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 SLC25A13Q9UJS0 675 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 FAM170AA1A519 330 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ADH1BP00325 375 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 IGHV4-34P06331 123 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 C7P10643 843 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 NOS2P35228 1153 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 CLCN1P35523 988 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 CENPCQ03188 943 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 AUHQ13825 339 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ARID5BQ14865 1188 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 VWA3BQ502W6 1294 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 PTPRN2Q92932 1015 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 FAM129BQ96TA1 746 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 CDC6Q99741 560 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 CLSTN2Q9H4D0 955 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 SIX2Q9NPC8 291 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 FZD4Q9ULV1 537 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 AKAP13Q12802 2813 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TBC1D3EA0A087X179 549 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 A0A1W2PPC4 97 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TBC1D3LB9A6J9 549 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 H0Y8X5 98 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 BNIP3LO60238 219 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 CBFA2T3O75081 653 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 DAB1O75553 588 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TBC1D3HP0C7X1 549 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 VAV1P15498 845 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ZNF18P17022 549 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 GOT1P17174 413 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 C5AR1P21730 350 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 GGCXP38435 758 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 CCT8P50990 548 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 RACK1P63244 317 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 IL9RQ01113 521 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 MTA1Q13330 715 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 CCDC157Q569K6 752 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 OLFML1Q6UWY5 402 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 SLCO6A1Q86UG4 719 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 IGSF8Q969P0 613 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 SLC6A18Q96N87 628 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 WDCPQ9H6R7 721 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.146e-9■■■■□ 25.1
HOXB3-204ENST00000465120 VPS28Q9UK41 221 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 PAGE1O75459 146 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 SULT1E1P49888 294 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 PLK1P53350 603 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 DPCR1Q3MIW9 517 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 KCNT1Q5JUK3 1230 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TAF3Q5VWG9 929 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 DSG4Q86SJ6 1040 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 GLRX5Q86SX6 157 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 FAM71AQ8IYT1 594 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 AADATQ8N5Z0 425 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 OR8D1Q8WZ84 308 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 SPAG5Q96R06 1193 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 TKTL2Q9H0I9 626 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 MUC3BQ9H195 1237 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 RRN3Q9NYV6 651 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXB3-204ENST00000465120 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms