RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM66O15016 1216 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CREB3O43889 395 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 UGT1A9O60656 530 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 MAFKO60675 156 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 GSRP00390 522 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PRKCGP05129 697 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 GALTP07902 379 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ALADP13716 330 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 KRT4P19013 534 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 MX2P20592 715 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 GPR15P49685 360 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 CRYMQ14894 314 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC14Q15048 493 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 RTP2Q5QGT7 225 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 CAPN12Q6ZSI9 719 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 C14orf80Q86SX3 495 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 MON1AQ86VX9 555 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SLC26A11Q86WA9 606 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC6Q86X45 466 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PALM2Q8IXS6 379 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 GSDMBQ8TAX9 411 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 TOX2Q96NM4 488 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 VAT1Q99536 393 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 NAT9Q9BTE0 207 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 CWH43Q9H720 699 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 TBX21Q9UL17 535 aa5.79□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ALPK3Q96L96 1907 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 GFRA2O00451 464 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CAPN9O14815 690 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 KLF11O14901 512 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 MATN3O15232 486 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 TM9SF1O15321 606 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 MSI1O43347 362 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 HOXA2O43364 376 aa5.78□□□□□ -1.48
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PTPRC-210ENST00000462363 ZWINTO95229 277 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PARNO95453 639 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 PGAM1P18669 254 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ATF6P18850 670 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 NFKB1P19838 968 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CCNCP24863 283 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 ADRA1DP25100 572 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 MGAT1P26572 445 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 EPHB2P29323 1055 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 CCR1P32246 355 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 SERPINB6P35237 376 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRC-210ENST00000462363 MSH2P43246 934 aa5.78□□□□□ -1.48
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