RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462166.1

TPRKB-204, Transcript of TP53RK binding protein, human

TSL 3

Gene TPRKB, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPRKB-204	ENST00000462166	MPP7	Q5T2T1	576 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	MBLAC2	Q68D91	279 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ANO7	Q6IWH7	933 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	STRADA	Q7RTN6	431 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	APCDD1	Q8J025	514 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ZNF366	Q8N895	744 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	UCMA	Q8WVF2	138 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	HMGB4	Q8WW32	186 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	DNAJC7	Q99615	494 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	CHP1	Q99653	195 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	THAP2	Q9H0W7	228 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ISCU	Q9H1K1	167 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	MPP6	Q9NZW5	540 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	INVS	Q9Y283	1065 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	THADA	Q6YHU6	1953 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	NUP205	Q92621	2012 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166		A0A1B0GVM2	712 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ESPN	B1AK53	854 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166		E9PAM4	449 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	SRGAP2	O75044	1071 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ENDOD1	O94919	500 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	APBB3	O95704	486 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	HLA-E	P13747	358 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	PRKCH	P24723	683 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	PLA2G5	P39877	138 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	CSK	P41240	450 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	IL12RB1	P42701	662 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	NRL	P54845	237 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ZNF234	Q14588	700 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	LPAL2	Q16609	132 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ALF	Q53S48	1182 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	RNF43	Q68DV7	783 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	SDE2	Q6IQ49	451 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	AHI1	Q8N157	1196 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	NELL1	Q92832	810 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	TRIM11	Q96F44	468 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	BTBD6	Q96KE9	485 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	LMLN	Q96KR4	655 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	CNPY3	Q9BT09	278 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	DEF6	Q9H4E7	631 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TPRKB-204	ENST00000462166	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TPRKB-204	ENST00000462166		A0A1W2PQF6	199 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPRKB-204	ENST00000462166	FAM72C	H0Y354	149 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPRKB-204	ENST00000462166	AXIN1	O15169	862 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPRKB-204	ENST00000462166	MYBL1	P10243	752 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TPRKB-204	ENST00000462166	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TPRKB-204	ENST00000462166	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
TPRKB-204	ENST00000462166	ADRA1B	P35368	520 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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