RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 EPN2O95208 641 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 MT-CO1P00395 513 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 EPHX1P07099 455 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 RETP07949 1114 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 DLDP09622 509 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT3P12035 628 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PTMSP20962 102 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCB4P21439 1286 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 GLDCP23378 1020 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGER3P43115 390 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 METAP1P53582 386 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF445P59923 1031 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 BRMS1LQ5PSV4 323 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf64Q5T6V5 341 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 MANEALQ5VSG8 457 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PMS2CLQ68D20 193 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TCEAL6Q6IPX3 200 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CACUL1Q86Y37 369 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CPNE8Q86YQ8 564 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TMPRSS6Q8IU80 811 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 AHI1Q8N157 1196 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf20Q8ND61 904 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM172AQ8WUF8 416 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPRN2Q92932 1015 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TCEAL3Q969E4 200 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 RMDN1Q96DB5 314 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PEBP4Q96S96 227 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM129BQ96TA1 746 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 HINFPQ9BQA5 517 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 SELENOOQ9BVL4 669 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 RRN3Q9NYV6 651 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 NCDNQ9UBB6 729 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 STAP1Q9ULZ2 295 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPN11Q9UMQ6 739 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP250Q9BV73 2442 aa7.22□□□□□ -1.25
RABGEF1-206ENST00000461017 SPEGQ15772 3267 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087X0T9 212 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GVM2 712 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PQJ5 194 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 K7ERQ8 282 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 TIMM44O43615 452 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SRGAP2O75044 1071 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SIN3BO75182 1162 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ALDH1A2O94788 518 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CD160O95971 181 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 F9P00740 461 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CALB1P05937 261 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM228BP0C875 321 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC2A3P11169 496 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 TCF4P15884 667 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 GPD1P21695 349 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 MAOBP27338 520 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CASP14P31944 242 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 ADRA1BP35368 520 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPN9P43378 593 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 NSFP46459 744 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 PLK1P53350 603 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX16P57768 344 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS14P62263 151 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 MAMLD1Q13495 774 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CDH18Q13634 790 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 CA9Q16790 459 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 SDE2Q6IQ49 451 aa7.21□□□□□ -1.26
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC24Q6P3W2 148 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms