RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 IL6P05231 212 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 PRKCIP41743 596 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 NAGLUP54802 743 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 KCTD2Q14681 263 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 NIM1KQ8IY84 436 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 ACSS2Q9NR19 701 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 ALDH4A1P30038 563 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 MAGEA8P43361 318 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 TAS2R1Q9NYW7 299 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 FADS3Q9Y5Q0 445 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 F8VP50 259 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 C19orf60Q96EN9 201 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 NCANO14594 1321 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 UGT1A9O60656 530 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 UGT1A6P19224 532 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 UGT1A1P22309 533 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 UGT1A4P22310 534 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 UGT1A3P35503 534 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 UGT1A5P35504 534 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 CRKP46108 304 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 PRIM2P49643 509 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 NPNTQ6UXI9 565 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 CDH9Q9ULB4 789 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.92□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 DHRS12A0PJE2 317 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 FGFR2P21802 821 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 FAM149AA5PLN7 773 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 TMCC2O75069 709 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 AVILO75366 819 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 KRT20P35900 424 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 TNFAIP1Q13829 316 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 KRT73Q86Y46 540 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 RPTORQ8N122 1335 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 H3BNX3 289 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 DGAT1O75907 488 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 CRTAMO95727 393 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 LGALS3BPQ08380 585 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 PUDPQ08623 228 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 NAT9Q9BTE0 207 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 SQORQ9Y6N5 450 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 FAM155BO75949 473 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 TUBA4AP68366 448 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 IL18R1Q13478 541 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 TTC23Q5W5X9 447 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 AFG1LQ8WV93 481 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 PLOD3O60568 738 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 CYP4B1P13584 511 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 CCNA1P78396 465 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 NR6A1Q15406 480 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 KCNMB4Q86W47 210 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 ALLCQ8N6M5 410 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 CLCN2P51788 898 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 DPYSQ14117 519 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 SV2AQ7L0J3 742 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 BTBD9Q96Q07 612 aa14.91□□□□□ -0.02
PCNX1-202ENST00000439984 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms