RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PASD1Q8IV76 773 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 FAM131CQ96AQ9 280 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC12Q9UKB3 198 aa21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 VILLO15195 856 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ERBB2P04626 1255 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 GOT1P17174 413 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 NOS2P35228 1153 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CLCN1P35523 988 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 KRT9P35527 623 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CTSKP43235 329 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CCT8P50990 548 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 C5orf22Q49AR2 442 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 FBXL22Q6P050 247 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 NCEH1Q6PIU2 408 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 GANCQ8TET4 914 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SPAG5Q96R06 1193 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 OMDQ99983 421 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM51Q9NW97 253 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 RRN3Q9NYV6 651 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa21.63■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CAPNS1P04632 268 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PDGFRAP16234 1089 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 STK19P49842 368 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CCR5P51681 352 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 BPIFB4P59827 614 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A3Q01959 620 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SLC47A2Q86VL8 602 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 AADATQ8N5Z0 425 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 RHBDD1Q8TEB9 315 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 FRS2Q8WU20 508 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 RNF34Q969K3 372 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ALG14Q96F25 216 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 NDST4Q9H3R1 872 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 GRAP2O75791 330 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SCNN1AP37088 669 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 GRK6P43250 576 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ADPRHP54922 357 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 VWA3BQ502W6 1294 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 MIIPQ5JXC2 388 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 STK40Q8N2I9 435 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SKA1Q96BD8 255 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 DACH1Q9UI36 760 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.61■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SLC7A4O43246 635 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 ATP9BO43861 1147 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CLDN11O75508 207 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PSMD8P48556 350 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 INAVAQ3KP66 663 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 LAYNQ6UX15 382 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 DSG4Q86SJ6 1040 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 PNPLA1Q8N8W4 532 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 NT5C3BQ969T7 300 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SLC6A18Q96N87 628 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 NPY6RQ99463 290 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 SYNCQ9H7C4 482 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 EBF2Q9HAK2 575 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 COX16Q9P0S2 106 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.6■■□□□ 1.05
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms