RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 CUL5Q93034 780 aa4.69□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CHMP4AQ9BY43 222 aa4.69□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ACAD9Q9H845 621 aa4.69□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.69□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 THAP1Q9NVV9 213 aa4.69□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 KLQ9UEF7 1012 aa4.69□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 PKP3Q9Y446 797 aa4.69□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 E5RJQ4 531 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 SYN3O14994 580 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CTSAP10619 480 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 GSTM2P28161 218 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 AVPR2P30518 371 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ID2Q02363 134 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB16Q05516 673 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 EFR3AQ14156 821 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CCDC142Q17RM4 750 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 Q4G0T1 1027 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 GXYLT1Q4G148 440 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 COLEC12Q5KU26 742 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 FAM57BQ71RH2 274 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CPOQ8IVL8 374 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD44Q8N8A2 993 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TWNKQ96RR1 684 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 RASSF1Q9NS23 344 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.68□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CCDC189A1A4V9 331 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 DPPA5A6NC42 116 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 MSI1O43347 362 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 POLBP06746 335 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CYP4B1P13584 511 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CIITAP33076 1130 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 OAZ1P54368 228 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 GALNT3Q14435 633 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD1Q15327 319 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CBWD5Q5RIA9 395 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 LRIG3Q6UXM1 1119 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ZNF793Q6ZN11 406 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ZNF575Q86XF7 245 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 KLBQ86Z14 1044 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 STAMQ92783 540 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 KAT2AQ92830 837 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 SLC22A11Q9NSA0 550 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 GGA3Q9NZ52 723 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.67□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 WDR91A4D1P6 747 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 SAC3D1A6NKF1 404 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 KCNJ18B7U540 433 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 F8W810 466 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 NCAM2O15394 837 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ANP32CO43423 234 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TLR2O60603 784 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 PYGLP06737 847 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ARSAP15289 507 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TYK2P29597 1187 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 RPS6KA3P51812 740 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 RHAGQ02094 409 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 UBE3AQ05086 875 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 MORN5Q5VZ52 161 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 HERVK_113Q902F9 699 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 REEP2Q9BRK0 252 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.66□□□□□ -1.66
RBM39-211ENST00000426951 RHODO00212 210 aa4.65□□□□□ -1.67
RBM39-211ENST00000426951 PEX12O00623 359 aa4.65□□□□□ -1.67
RBM39-211ENST00000426951 KLK10O43240 276 aa4.65□□□□□ -1.67
RBM39-211ENST00000426951 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RBM39-211ENST00000426951 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RBM39-211ENST00000426951 WNT1P04628 370 aa4.65□□□□□ -1.67
RBM39-211ENST00000426951 MMP13P45452 471 aa4.65□□□□□ -1.67
RBM39-211ENST00000426951 CCR5P51681 352 aa4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms