RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 RRN3Q9NYV6 651 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CEP83Q9Y592 693 aa21.48■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 A0A1W2PP55 124 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FLRT2O43155 660 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 GRAP2O75791 330 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ADH1BP00325 375 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 PDGFRAP16234 1089 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 NOS2P35228 1153 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 STK19P49842 368 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 BPIFB4P59827 614 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 AUHQ13825 339 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 C5orf22Q49AR2 442 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FRS2Q8WU20 508 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 IGSF8Q969P0 613 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 FAM131CQ96AQ9 280 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ALG14Q96F25 216 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 NEUROG2Q9H2A3 272 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 DACH1Q9UI36 760 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SNX11Q9Y5W9 270 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.47■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 A0A1W2PPC4 97 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 C5AR1P21730 350 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SLC8A1P32418 973 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 SCNN1AP37088 669 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CTSKP43235 329 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 CENPCQ03188 943 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 NCEH1Q6PIU2 408 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 AADATQ8N5Z0 425 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 GANCQ8TET4 914 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 RNF34Q969K3 372 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 NT5C3BQ969T7 300 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 NPY6RQ99463 290 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 COX16Q9P0S2 106 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 OR51B4Q9Y5P0 310 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 KNL1Q8NG31 2342 aa21.46■■□□□ 1.03
UBXN4-204ENST00000426921 LRRC72A6NJI9 287 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 DKK1O94907 266 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 GOT1P17174 413 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 NNMTP40261 264 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 GABRB2P47870 512 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 PSMD8P48556 350 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 IRAK1P51617 712 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 KCNMA1Q12791 1236 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 NME3Q13232 169 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 LAYNQ6UX15 382 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 STK40Q8N2I9 435 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 SPAG5Q96R06 1193 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 PPP1R9BQ96SB3 815 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 OMDQ99983 421 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 SYNCQ9H7C4 482 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 PLCB1Q9NQ66 1216 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 FREM2Q5SZK8 3169 aa21.45■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 PLXNA2O75051 1894 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM131Q92545 1883 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 M0QYT0 321 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 VILLO15195 856 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 ATP9BO43861 1147 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHGA12O60330 932 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 PAGE1O75459 146 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 CLDN11O75508 207 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 CYP11B1P15538 503 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 CCR5P51681 352 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 ADPRHP54922 357 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 OR52K2Q8NGK3 314 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 CDC6Q99741 560 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 EBF2Q9HAK2 575 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 PIGVQ9NUD9 493 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM51Q9NW97 253 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.44■■□□□ 1.02
UBXN4-204ENST00000426921 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms