RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417157.2

SLC13A3-205, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC13A3, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-205ENST00000417157 SCML1Q9UN30 329 aa14.61□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 SRGAP2O75044 1071 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 RTN2O75298 545 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 GJB6O95452 261 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 ADRA1BP35368 520 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 HOXD12P35452 270 aa14.6□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 HDAC4P56524 1084 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 SCAPQ12770 1279 aa14.6□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 C14orf80Q86SX3 495 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 APCDD1Q8J025 514 aa14.6□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 ITM2CQ9NQX7 267 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.6□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 DMDP11532 3685 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.079e-11■■■□□ 17
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SLC13A3-205ENST00000417157 IGLV3-19P01714 112 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 SKILP12757 684 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 TGM1P22735 817 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 ALFQ53S48 1182 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 TMEFF1Q8IYR6 380 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 NETO1Q8TDF5 533 aa14.59□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.59□□□□□ -0.07
SLC13A3-205ENST00000417157 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 USP34Q70CQ2 3546 aa14.58□□□□□ -0.07
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SLC13A3-205ENST00000417157 CNTN5O94779 1100 aa14.58□□□□□ -0.08
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SLC13A3-205ENST00000417157 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 HGSNATQ68CP4 663 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.58□□□□□ -0.08
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SLC13A3-205ENST00000417157 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa14.58□□□□□ -0.08
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SLC13A3-205ENST00000417157 CACUL1Q86Y37 369 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 SYT12Q8IV01 421 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 FRMD1Q8N878 549 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 RNF214Q8ND24 703 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 CADM4Q8NFZ8 388 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SLC13A3-205ENST00000417157 CCDC114Q96M63 670 aa14.58□□□□□ -0.08
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