RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 CSPG4P5Q96PW8 444 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 DTLQ9NZJ0 730 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 SLX4Q8IY92 1834 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 HUS1O60921 280 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 TIPRLO75663 272 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 SUPT7LO94864 414 aa8.51□□□□□ -1.05
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SNX13-201ENST00000409076 TAP1Q03518 808 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 MPP3Q13368 585 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
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SNX13-201ENST00000409076 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 EPAS1Q99814 870 aa8.51□□□□□ -1.05
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SNX13-201ENST00000409076 SPON1Q9HCB6 807 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.51□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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SNX13-201ENST00000409076 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 PDLIM1O00151 329 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 ACKR2O00590 384 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 STBD1O95210 358 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 C2P06681 752 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 NMBRP28336 390 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 CA8P35219 290 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 GSSP48637 474 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 PSMD7P51665 324 aa8.5□□□□□ -1.05
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SNX13-201ENST00000409076 KCNMB4Q86W47 210 aa8.5□□□□□ -1.05
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SNX13-201ENST00000409076 GLRA3O75311 464 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 CILPO75339 1184 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 BEST1O76090 585 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 RECQL4O94761 1208 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 PCNAP12004 261 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 TKTL1P51854 596 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 KLF10Q13118 480 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 MYO9BQ13459 2157 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 PTK2BQ14289 1009 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 GRM3Q14832 879 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 NEDD8Q15843 81 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 LIN52Q52LA3 116 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 BOLA3Q53S33 107 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
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SNX13-201ENST00000409076 ARMC7Q9H6L4 198 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 USP29Q9HBJ7 922 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 PREBQ9HCU5 417 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 PFDN4Q9NQP4 134 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 A6NHS1 94 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 PLIN3O60664 434 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 SERPINE1P05121 402 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 MYL3P08590 195 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 ITGAXP20702 1163 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 EPHX2P34913 555 aa8.5□□□□□ -1.05
SNX13-201ENST00000409076 BCAT1P54687 386 aa8.5□□□□□ -1.05
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