RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 Q6ZNB5 142 aa20.67■□□□□ 0.9
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ODC1-202ENST00000405333 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.67■□□□□ 0.9
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ODC1-202ENST00000405333 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
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ODC1-202ENST00000405333 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
ODC1-202ENST00000405333 AGAP3Q96P47 875 aa20.63■□□□□ 0.89
ODC1-202ENST00000405333 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ODC1-202ENST00000405333 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.63■□□□□ 0.89
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